Μιλώντας για αντιβίωση και χλωρίδα του εντέρου εννοούμε βακτηρίδια. Η αντιβίωση εξοντώνει σχεδόν όλα τα βακτηρίδια ενώ τα προβιοτικά βακτήρια εμπλουτίζουν τη χλωρίδα του εντέρου με μη παθογόνα (ωφέλιμα) βακτηρίδια.
Τα κοκκίδια είναι παράσιτα του εντέρου και το φάρμακο που τα εξοντώνει δεν πλήττει τα βακτηρίδια.
Βέβαια, η χορήγηση προβιοτικών ανά διαστήματα κάνει καλό ούτως ή άλλως, οπότε θα μπορούσαν να χορηγηθούν ακόμη και μετά το baycox.